[INFO COVID] - Séquençage du SARS-Cov-2

A compter du 21 juin 2021, le ministère de la santé autorise les laboratoires privés à réaliser le séquençage du SARS-CoV-2 dans certaines indications afin d’augmenter les capacités de séquençage et la représentativité des échantillons analysés sur le territoire national. Les modalités précises de ce séquençage, réalisé par les laboratoires privés, sont décrites dans l’arrêté du 19 juin 2021 et le MINISANTE N°2021-82 selon les 3 indications suivantes :

  • Séquençage de tout échantillon dont le test de criblage est positif pour au moins l’une des 3 mutations :
    •  E484K
    •  E484Q
    •  L452R
    • NB1: le laboratoire Cerba génère de façon automatique la réalisation des séquençages à partir des tests de criblages positifs (sous réserve d'une charge virale suffisante).
    • NB2 : Cette mesure est temporaire et pourrait évoluer en fonction de l'apparition de nouvelles mutations d'intérêt.
  • Séquençage à visée interventionnelle : documentation de clusters, demandes émanant d’une ARS (joindre impérativement la demande de l'ARS au dossier).
  • Séquençage de voyageurs en retour de l’étranger hors UE détectés positifs dans les 14 derniers jours suivant leur retour ou leur arrivée sur le territoire français : le séquençage doit être pratiqué quel que soit le résultat du criblage.

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